Download de dados de COVID-19 no Brasil

coronabr é um pacote de R para fazer download e visualizar os dados dos casos diários de coronavírus (COVID-19) disponibilizados por diferentes fontes:

Nosso objetivo

O nosso objetivo é facilitar o acesso aos dados de diferentes fontes, usando ferramentas de acesso aberto e que permitam reprodutibilidade.

O código é aberto. Entre em como usar para um exemplo de como utilizar o pacote. Compartilhe.

Fazemos ciência aberta, democrática e reprodutível. Este é um trabalho em desenvolvimento. Para entender como contribuir, clique aqui.

Aviso!

Disponibilizamos aqui atualizações dos gráficos. Sabemos que deve haver maneiras responsáveis de apresentar estes dados e que as comparações entre regiões e países dependem de muitas variáveis.

Os dados são referentes aos casos notificados. É sabido que temos subnotificação e atraso nas notificações. Assim, mais do que nunca, não refletem a epidemia em si.

Sobre os dados

Antes de mais nada, declaramos nossa postura alinhada com as ideias de uma ciência de dados responsável, compromissada e feminista. Somos pessoas alinhadas com o manifest-no, refutamos regimes de dados prejudiciais e nos comprometemos a novos futuros de dados.

Apesar de acreditarmos no acesso sem distinção a dados abertos, não recomendamos que toda análise que possa ser feita o seja. Ao se tratar de uma situação de saúde pública delicada, visualizações, extrapolações, e predições devem ser feitas com todo cuidado, lembrando que a qualidade dos dados é incerta e que todo dado diz respeito a uma pessoa.

No Brasil, a notificação de casos carrega consigo vieses espaciais, econômicos e de classe que não podem ser ignorados. Para ver modelos responsáveis de previsão do crescimento no número de casos veja o Observatório COVID-19 Brasil (um grupo colaborativo de pessoas cientistas brasileiras) e o Mapa de previsão da propagação da COVID-19 por contágio comunitário no Brasil.

Nota sobre os dados disponibilizados pelo Ministério da Saúde

A partir de 2020-03-14, a notificação de casos graves de COVID-19 foca apenas nos casos graves que são atendidos nos hospitais.
Até 2020-03-18 o ministério de saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado na página http://plataforma.saude.gov.br/novocoronavirus/#COVID-19-brazil
Entre 2020-03-18 e 2020-03-25, a página original do Ministério da Saúde parou de funcionar e os dados de casos de coronavirus COVID-19 discriminados por estado foram divulgados em apresentações de powerpoint e PDFs no blog do Ministério. Adriano Belisario fez a compilação manual destes dados neste repositório
A partir de 2020-03-26 o Ministério de Saúde brasileiro disponibilizou os dados de casos de coronavirus COVID-19 na página https://covid.saude.gov.br/
A partir de 2020-03-28 a opção de fazer download da série histórica por casos voltou a estar disponível. Depois disso, o padrão tem mudado frequentemente, inclusive no formato de disponibilização dos dados que agora é em .xls e não mais .csv. Neste momento, temos uma função estável get_corona_minsaude() para o download desses dados (instruções de como usar aqui).

Visualizando os dados

Importante lembrar que desde 2020-03-27 tem muitos testes sem resultados e que os dados não refletem a epidemia e sim as notificações - e que essas estão atrasadas devido ao atraso no resultado dos testes.

Entre aqui para acompanhar os casos na América Latina (versão em espanhol aqui)